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Comparação dos algoritmos delineação rápida em cadeia e seriação, para a construção de mapas genéticos PAB
Mollinari,Marcelo; Margarido,Gabriel Rodrigues Alves; Garcia,Antonio Augusto Franco.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência, na construção de mapas genéticos, dos algoritmos seriação e delineação rápida em cadeia, além dos critérios para avaliação de ordens: produto mínimo das frações de recombinação adjacentes, soma mínima das frações de recombinação adjacentes e soma máxima dos LOD Scores adjacentes, quando usados com o algoritmo de verificação de erros " ripple" . Foi simulado um mapa com 24 marcadores, posicionados aleatoriamente a distâncias variadas, com média 10 cM. Por meio do método Monte Carlo, foram obtidas 1.000 populações de retrocruzamento e 1.000 populações F2, com 200 indivíduos cada, e diferentes combinações de marcadores dominantes e co-dominantes (100% co-dominantes, 100% dominantes e mistura com 50%...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Algoritmo ripple; Dados perdidos; Marcadores dominantes e co-dominantes; Método Monte Carlo; QTL.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000400009
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